根据我国《民事诉讼法》的规定，当判决、裁定等法律文书中所确定的被执行人义务为特定行为时，被执行人未按执行通知履行的，人民法院可以强制执行或者委托相关单位或者其他人完成，费用由被执行人承担。在被执行人对判决结果不满意时，强制要求被执行人按照法律文书履行自身义务可能性很小。因此法律设立了变通方式，对于可由他人完成的义务，允许由被执行人以外的人代为履行，而代为履行产生的费用由被执行人承担，将被执行人的行为之债转化为金钱之债，从而保障申请执行人的权利。
采取代为执行措施应注意以下几个方面：一是执行标的行为必须是非人身性的行为，对赔礼道歉、探视权等涉及人身性的行为不能适用代执行措施；二是适用代为履行的前提条件是被执行人未按执行通知履行义务；三是代为履行产生的费用一般由申请执行人垫付，但最终由被执行人承担。
本问题所涉及的情况中，在被执行人收到法院的执行通知后，未按照执行通知履行义务的，执行法院可以委托他人代替完成拆除自建房的义务，产生的费用，由申请执行人垫付，最终由被执行人承担。法律对法院委托申请人代为履行的措施没有禁止性规定，因此在法院委托时也可由申请执行人自行清理。
由此可见，申请执行人代为履行法律义务的做法在法律制度上是行得通的。但作为一个社会理性人来说，还应能预测自身行为中的法律风险。就申请执行人自行代为履行而言，首先，应尽到通知义务，告知被执行人自己的代为履行行为。其次，在代为履行过程中应尽到善意义务。最后，申请执行人应能对自己的代为履行行为费用发票收据留存，作为日后要求支付该费用的依据。在执行程序中最好的做法是，及时向执行法院表达代为履行意愿，在执行法院主持下进行，并由执行法院通过执法记录仪全程摄像、存档于执行案卷，避免日后产生争议。